Секвенирование ДНК быстро определяет устойчивые к антибиотикам бактерии

Ученые из Университета Джона Хопкинса доказали, что технология быстрого секвенирования генов может ускорить идентификацию определенных штаммов бактерий, устойчивых к антибиотикам. Работа проводилась под руководством доцента Праниты Тамма. Результаты исследования появились на сайте университета 17 января.

Количество устойчивых к лекарственным средствам бактериальных инфекций резко возросло за последние пару десятилетий. Это происходит из-за чрезмерно частого использования антибиотиков и из-за легкости, с которой бактерии могут приобретать новые гены резистентности, особенно в условиях больниц, где различные штаммы могут без препятствий скрещиваться. В настоящее время типичные лабораторные тесты для выявления конкретных штаммов бактерий требуют 24 часа для выращивания микробной культуры, отобранной у пациентов, плюс дополнительные 24–48 часов для определения того, какие обычно используемые антибиотики будут эффективны.

В новой работе доктор Тамма использовала ДНК-секвенатор с нанопорами — новый вид технологии, который дает результаты намного быстрее, чем другие инструменты секвенирования ДНК, поскольку он измеряет электрический сигнал во время прохождения нити ДНК через крошечные поры. Электрический сигнал контролируется в режиме реального времени, что позволяет анализировать результаты секвенирования в течение нескольких минут. Другим секвенсорам требуется минимум 24 часа для анализа результатов. Исследователи использовали новый секвенатор для выявления генов устойчивости к антибиотикам у нескольких штаммов Klebsiella pneumoniae, бактерий, которые обитают в кишечнике человека и могут быть как абсолютно безвредными, так и вызывать серьезные инфекции.

Команда собрала клинические образцы K. pneumoniae у 40 взрослых пациентов, госпитализированных в больницу Джона Хопкинса, извлекла бактериальную ДНК и провела ее через секвенатор. Исследователи использовали два разных подхода к определению генов резистентности. Самой эффективной оказалась методика, занявшая 14 часов: за это время ученые смогли определить резистентные гены с точностью до 92% и подобрать антибиотики для лечения каждого конкретного случая заражения инфекцией K. pneumoniae.

Материалы по теме:

Полимерный эстроген защищает нервные клетки

Исследователи из Политехнического института Rensselaer продемонстрировали, как эстроген может полимеризоваться в медленно высвобождающийся биоматериал и наноситься на клетки нервной системы для их защиты или регенерации. Над проектом работали доктора Райан Гилберт и Эдмунд Палермо. Описание функций новой разработки было опубликовано 23 ...

Не быть тебе Рапунцель. 13 ошибок, которые мы совершаем при расчесывании

Правда ли, что расчески из пластика хуже деревянных, так ли хороши для наших волос щетки с натуральной щетиной и нужно ли долго расчесываться, чтобы стать обладательницей густой шевелюры, рассказывает парикмахер-стилист Александра Эдельберг. Мягкие, густые, блестящие — кто из нас не мечтает о роскошных волосах? Но добиться нужного результата ...

Восстанав­ливаются ли нервные клетки?

Восстанавливаются ли нервные клетки? – Действительно, долгое время считалось, что нейроны закладываются внутриутробно, человек рождается с определённым набором этих клеток, а в течение жизни они утрачиваются, – ответил ведущий научный сотрудник Научного цент­ра неврологии кандидат медицинских наук Антон Раскуражев. – Последние исследования показали, ...

Отпуск от аллергии. Где лучше отдыхать при поллинозе?

Статья из газеты: АиФ Здоровье №11 11/06/2019 Все материалы сюжета В отпуск При планировании отпуска родители обычно руковод­ствуются финансовыми с­оображениями и интересами детей. А вот мамам и папам ребят с поллинозом приходится учитывать и то, чтобы там, куда они поедут, в это время не цвело ничего из того, что их чада категорически не переносят. Наш эксперт – ...