Секвенирование ДНК быстро определяет устойчивые к антибиотикам бактерии

Ученые из Университета Джона Хопкинса доказали, что технология быстрого секвенирования генов может ускорить идентификацию определенных штаммов бактерий, устойчивых к антибиотикам. Работа проводилась под руководством доцента Праниты Тамма. Результаты исследования появились на сайте университета 17 января.

Количество устойчивых к лекарственным средствам бактериальных инфекций резко возросло за последние пару десятилетий. Это происходит из-за чрезмерно частого использования антибиотиков и из-за легкости, с которой бактерии могут приобретать новые гены резистентности, особенно в условиях больниц, где различные штаммы могут без препятствий скрещиваться. В настоящее время типичные лабораторные тесты для выявления конкретных штаммов бактерий требуют 24 часа для выращивания микробной культуры, отобранной у пациентов, плюс дополнительные 24–48 часов для определения того, какие обычно используемые антибиотики будут эффективны.

В новой работе доктор Тамма использовала ДНК-секвенатор с нанопорами — новый вид технологии, который дает результаты намного быстрее, чем другие инструменты секвенирования ДНК, поскольку он измеряет электрический сигнал во время прохождения нити ДНК через крошечные поры. Электрический сигнал контролируется в режиме реального времени, что позволяет анализировать результаты секвенирования в течение нескольких минут. Другим секвенсорам требуется минимум 24 часа для анализа результатов. Исследователи использовали новый секвенатор для выявления генов устойчивости к антибиотикам у нескольких штаммов Klebsiella pneumoniae, бактерий, которые обитают в кишечнике человека и могут быть как абсолютно безвредными, так и вызывать серьезные инфекции.

Команда собрала клинические образцы K. pneumoniae у 40 взрослых пациентов, госпитализированных в больницу Джона Хопкинса, извлекла бактериальную ДНК и провела ее через секвенатор. Исследователи использовали два разных подхода к определению генов резистентности. Самой эффективной оказалась методика, занявшая 14 часов: за это время ученые смогли определить резистентные гены с точностью до 92% и подобрать антибиотики для лечения каждого конкретного случая заражения инфекцией K. pneumoniae.

Материалы по теме:

Наклон головы при разговоре вызывает доверие собеседника

Наклон головы во время диалога позволяет установить зрительный контакт между собеседниками и способствует развитию доверия. Об этом сообщили специалисты из Калифорнийского Университета в Санта-Круз. Статья с описанием наблюдений была опубликована 27 декабря на официальном сайте образовательного учреждения. Смотря на чье-то ...

Ученые поняли, как развивается деменция

Ученые нашли способ прогнозировать распространение атрофии головного мозга, используя нейронное картирование. Проектом руководили Уильям Силли и Джесси Браун. Исследование было опубликовано в журнале Neuron 14 октября. Деменция - это общий термин для обозначения любого состояния, вызванного дегенерацией клеток головного мозга, ...

У вас ладони жёлтые. Правда и мифы о пользе моркови

Статья из газеты: Еженедельник "Аргументы и Факты" № 9 27/02/2019 С детства все знают, что в морковке очень много витамина А и что поэтому она очень полезна для зрения. Нашим учителям надо поставить двойку. Точно в глаз Этого витамина в моркови нет совсем. Но при этом для зрения эти ...

Сила голоса. Что обсуждали на Дне открытых дверей PLAY FM

Все материалы сюжета Здоровый голос Залог успеха для радио — это, конечно же, голос. Ведь искусство радио основано на звуковом сопровождении. И голос ведущих должен быть безупречным. Основное требование к радийному оратору заключается в красивом тембральном окрасе и отсутствии так называемых мелизмов (лишних эмоциональных окрашиваний ...