Секвенирование ДНК быстро определяет устойчивые к антибиотикам бактерии

Ученые из Университета Джона Хопкинса доказали, что технология быстрого секвенирования генов может ускорить идентификацию определенных штаммов бактерий, устойчивых к антибиотикам. Работа проводилась под руководством доцента Праниты Тамма. Результаты исследования появились на сайте университета 17 января.

Количество устойчивых к лекарственным средствам бактериальных инфекций резко возросло за последние пару десятилетий. Это происходит из-за чрезмерно частого использования антибиотиков и из-за легкости, с которой бактерии могут приобретать новые гены резистентности, особенно в условиях больниц, где различные штаммы могут без препятствий скрещиваться. В настоящее время типичные лабораторные тесты для выявления конкретных штаммов бактерий требуют 24 часа для выращивания микробной культуры, отобранной у пациентов, плюс дополнительные 24–48 часов для определения того, какие обычно используемые антибиотики будут эффективны.

В новой работе доктор Тамма использовала ДНК-секвенатор с нанопорами — новый вид технологии, который дает результаты намного быстрее, чем другие инструменты секвенирования ДНК, поскольку он измеряет электрический сигнал во время прохождения нити ДНК через крошечные поры. Электрический сигнал контролируется в режиме реального времени, что позволяет анализировать результаты секвенирования в течение нескольких минут. Другим секвенсорам требуется минимум 24 часа для анализа результатов. Исследователи использовали новый секвенатор для выявления генов устойчивости к антибиотикам у нескольких штаммов Klebsiella pneumoniae, бактерий, которые обитают в кишечнике человека и могут быть как абсолютно безвредными, так и вызывать серьезные инфекции.

Команда собрала клинические образцы K. pneumoniae у 40 взрослых пациентов, госпитализированных в больницу Джона Хопкинса, извлекла бактериальную ДНК и провела ее через секвенатор. Исследователи использовали два разных подхода к определению генов резистентности. Самой эффективной оказалась методика, занявшая 14 часов: за это время ученые смогли определить резистентные гены с точностью до 92% и подобрать антибиотики для лечения каждого конкретного случая заражения инфекцией K. pneumoniae.

Материалы по теме:

Объявить войну Марсу – пожалуйста! Чем отличаются талантливые люди?

Статья из газеты: Еженедельник "Аргументы и Факты" № 23 05/06/2019 Мы попросили рассказать о себе замечательного художника Михаила Дурново, с которым «АиФ» охотно сотрудничает. У меня ребёнок умный, добрый, но хулиган. Конфликтов возникает много — и в школе, и с соседями. Но ведь из хулиганов часто вырастают творческие люди, правда? А. Рудакова, Киров Действительно, примеров, когда из хулиганов ...

Пилинг, липосакция, татуаж. Почему процедуры красоты опасны?

Все материалы сюжета Журнал «АиФ Про Здоровье» № 3 (137), март 2019 Правда ли, что многие популярные процедуры, которые делают наши косметологи, за границей под запретом? Отвечает доктор медицинских наук, профессор, заведующая кафедрой дерматовенерологии и косметологии Центральной государственной медицинской академии Лариса Круглова. Все методы эстетической медицины в нашей ...

Недостаток белка ухудшает качество спермы

Недостаток белка в рационе мужчин ухудшает качество спермы, может оказать непосредственное влияние на здоровье их детей в долгосрочной перспективе. Исследование провели специалисты из Школы медицины и биологических наук Университета Ноттингема. Результаты работы были опубликованы сегодня на официальном сайте учебного заведения. ...

Курильщикам в депрессии сложнее бросить курить

Курильщики, подвергающиеся значительному психологическому стрессу, с меньшей вероятностью бросают курить. К такому выводу пришла группа ученых из Колумбийского университета (США). О своей работе они рассказали 1 ноября на сайте учебного заведения. Все больше людей отказываются от курения табака, и хотя ...