Секвенирование ДНК быстро определяет устойчивые к антибиотикам бактерии

Ученые из Университета Джона Хопкинса доказали, что технология быстрого секвенирования генов может ускорить идентификацию определенных штаммов бактерий, устойчивых к антибиотикам. Работа проводилась под руководством доцента Праниты Тамма. Результаты исследования появились на сайте университета 17 января.

Количество устойчивых к лекарственным средствам бактериальных инфекций резко возросло за последние пару десятилетий. Это происходит из-за чрезмерно частого использования антибиотиков и из-за легкости, с которой бактерии могут приобретать новые гены резистентности, особенно в условиях больниц, где различные штаммы могут без препятствий скрещиваться. В настоящее время типичные лабораторные тесты для выявления конкретных штаммов бактерий требуют 24 часа для выращивания микробной культуры, отобранной у пациентов, плюс дополнительные 24–48 часов для определения того, какие обычно используемые антибиотики будут эффективны.

В новой работе доктор Тамма использовала ДНК-секвенатор с нанопорами — новый вид технологии, который дает результаты намного быстрее, чем другие инструменты секвенирования ДНК, поскольку он измеряет электрический сигнал во время прохождения нити ДНК через крошечные поры. Электрический сигнал контролируется в режиме реального времени, что позволяет анализировать результаты секвенирования в течение нескольких минут. Другим секвенсорам требуется минимум 24 часа для анализа результатов. Исследователи использовали новый секвенатор для выявления генов устойчивости к антибиотикам у нескольких штаммов Klebsiella pneumoniae, бактерий, которые обитают в кишечнике человека и могут быть как абсолютно безвредными, так и вызывать серьезные инфекции.

Команда собрала клинические образцы K. pneumoniae у 40 взрослых пациентов, госпитализированных в больницу Джона Хопкинса, извлекла бактериальную ДНК и провела ее через секвенатор. Исследователи использовали два разных подхода к определению генов резистентности. Самой эффективной оказалась методика, занявшая 14 часов: за это время ученые смогли определить резистентные гены с точностью до 92% и подобрать антибиотики для лечения каждого конкретного случая заражения инфекцией K. pneumoniae.

Материалы по теме:

Как приготовить домашние компрессы и растирки от боли в пояснице?

Весной у дачников работы по горло – нужно и грядки вскопать, и граблями поработать, и деревья побелить. Мы с мужем просто обожаем наш участок. Он у нас маленький, но очень ухоженный – и огород есть, и цветник, и яблони с грушами. Правда, ...

Скажи мне, что ты слушаешь. Как наш музыкальный вкус связан с интеллектом?

В Оксфордском университете Брукса (Великобритания) провели исследование, целью которого было выяснить, существует ли зависимость музыкальных предпочтений человека от уровня его интеллекта. Интуитивно мы понимаем, что такая связь должна быть. Но вот что по этому поводу говорит наука? АиФ.ru решил разобраться в вопросе.   Металлисты — ...

Какие виды рака чаще всего диагностируют у россиян? Инфографика

Онкологи говорят о том, что сегодня во всем мире наблюдается устойчивая тенденция роста заболеваемости раком. Прогнозируется, что число страдающих злокачественными заболеваниями продолжит увеличиваться из-за старения населения, а также под влиянием экологических, экономических и других факторов. В России в 2017 году было выявлено ...

Токсикоз полезен?

Токсикоз полезен? Миф или правда. Говорят, учёные доказали: токсикоз сохраняет беременность, таким образом организм очищается и создаёт лучшие условия для развития ребёнка. Так зачем же врачи направляют с токсикозом в больницу? Отвечает профессор, заведующий кафедрой акушерства и гинекологии с курсом перинатологии РУДН Виктор Радзинский: —  Ранний токсикоз (возникает в первые недели беременности и заканчивается ...