Ученые создали 3D-карту генома сетчатки мыши

Ученые создали 3D-карту генома сетчатки мыши

Ученые создали 3D-карту генома сетчатки мыши

Специалисты из Детской исследовательской больницы Св. Иуды создали первую 3D-карту генома сетчатки мыши. Проектом руководил заведующий кафедрой нейробиологии доктор Майкл Дайер из Медицинского Института им. Говарда Хьюза. Статья с описанием новой карты появилась 4 августа на сайте больницы.

Исследования были сосредоточены на светочувствительных палочковых клетках в сетчатке мыши. В процессе развития сетчатки принимает участие около 8 000 генов, часть из которых активна, а часть – нет. На сам процесс также оказывают влияние и тысячи различных регуляторных областей по всему геному. Для картирования взаимодействий и процессов в этих палочках сетчатки ученые использовали определение конформации хромосом по методу анализа Hi-C.

Используя интегрированный анализ данных из различных источников и машинное обучение, исследователи смогли пронаблюдать, как геномная организация неожиданно менялась на разных этапах развития. Им удалось увидеть взаимодействия между агентами (участками ДНК, которые инициируют экспрессию генов) и энхансерами (участками, повышающими экспрессию генов) на разных стадиях развития сетчатки мыши, что привело к обнаружению супер-энхансера – необычайно мощного трансмиттера, который включался в клетке в определенный момент развития. При развитии рака, например, такой супер-трансмиттер может быть «хакнут» зловредными клетками, из-за чего болезнь начинает ускоренно развиваться.

Дальнейшие наблюдения показали, что, когда супер-энхансер основной регуляторной цепи гена Vsx2 был удален, целый класс нейронов (биполярные нейроны) переставал развиваться. Дайер и его коллеги использовали тот же подход для создания трехмерной геномной карты мозжечка мыши, структуры мозга, в которой может развиваться медуллобластома — наиболее распространенная злокачественная опухоль мозга. Они надеются, что в скором времени это даст свои результаты и приблизит ученых к пониманию того, как лечить это заболевание у детей.

Материалы по теме:

Ученые создали 3D-карту генома сетчатки мыши
Где достать суперъягоду аронию?
В Европе новая мода на какую-то суперъягоду аронию, очень полезную. Родом она из США. А у нас её можно где-то достать? Отвечает врач-гастро­энтеролог, кандидат м­едицинских наук Константин Спахов:– У нас этой аронии пруд пруди. Это всем знакомая черноплодная рябина. По вкусу она на ...
Ученые создали 3D-карту генома сетчатки мыши
Восстанав­ливаются ли нервные клетки?
Восстанавливаются ли нервные клетки? – Действительно, долгое время считалось, что нейроны закладываются внутриутробно, человек рождается с определённым набором этих клеток, а в течение жизни они утрачиваются, – ответил ведущий научный сотрудник Научного цент­ра неврологии кандидат медицинских наук Антон Раскуражев. – Последние исследования показали, ...
Ученые создали 3D-карту генома сетчатки мыши
Как навсегда избавиться от папиллом-«висюлек»?
Отвечает доктор Сергей Агапкин, ведущий программы «О самом главном»:– Папилломы появляются чаще всего у людей с ослабленной иммунной системой (перенёсших инфекционные заболевания, злоупотребляющих алкоголем, беспорядочными половыми контактами и т. д.). Чтобы они не появлялись вновь, после удаления необходимо провести противовирусную терапию, укрепляющую иммунитет. Папилломы ...
Ученые создали 3D-карту генома сетчатки мыши
Физиологический возраст важнее хронологического
Группа ученых Кливлендской клиники (США) установила, что физиологический возраст является более информативным показателем при расчете ожидаемой продолжительности жизни, чем хронологический. Руководителем проекта выступил С. Харб. Результаты исследования были опубликованы 13 февраля в журнале European Journal of Preventive Cardiology.  В медицине возраст считается одним из ...

Добавить комментарий

Войти с помощью: 

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *

Читайте ранее:
Перед встречей с Зеленским у депутатов забрали телефоны

КИЕВ, 5 сен - РИА Новости. На заседании парламентской фракции партии "Слуга народа", которое прошло

МЭР ответило на критику Мутко по поводу поддержки предпринимателей в Тулуне

МОСКВА, 5 сен - РИА Новости. Минэкономразвития РФ ответило на критику вице-премьера Виталия Мутко по

Закрыть
Яндекс.Метрика