Ученые создали 3D-карту генома сетчатки мыши

Ученые создали 3D-карту генома сетчатки мыши

Специалисты из Детской исследовательской больницы Св. Иуды создали первую 3D-карту генома сетчатки мыши. Проектом руководил заведующий кафедрой нейробиологии доктор Майкл Дайер из Медицинского Института им. Говарда Хьюза. Статья с описанием новой карты появилась 4 августа на сайте больницы.

Исследования были сосредоточены на светочувствительных палочковых клетках в сетчатке мыши. В процессе развития сетчатки принимает участие около 8 000 генов, часть из которых активна, а часть – нет. На сам процесс также оказывают влияние и тысячи различных регуляторных областей по всему геному. Для картирования взаимодействий и процессов в этих палочках сетчатки ученые использовали определение конформации хромосом по методу анализа Hi-C.

Используя интегрированный анализ данных из различных источников и машинное обучение, исследователи смогли пронаблюдать, как геномная организация неожиданно менялась на разных этапах развития. Им удалось увидеть взаимодействия между агентами (участками ДНК, которые инициируют экспрессию генов) и энхансерами (участками, повышающими экспрессию генов) на разных стадиях развития сетчатки мыши, что привело к обнаружению супер-энхансера – необычайно мощного трансмиттера, который включался в клетке в определенный момент развития. При развитии рака, например, такой супер-трансмиттер может быть «хакнут» зловредными клетками, из-за чего болезнь начинает ускоренно развиваться.

Дальнейшие наблюдения показали, что, когда супер-энхансер основной регуляторной цепи гена Vsx2 был удален, целый класс нейронов (биполярные нейроны) переставал развиваться. Дайер и его коллеги использовали тот же подход для создания трехмерной геномной карты мозжечка мыши, структуры мозга, в которой может развиваться медуллобластома — наиболее распространенная злокачественная опухоль мозга. Они надеются, что в скором времени это даст свои результаты и приблизит ученых к пониманию того, как лечить это заболевание у детей.

Материалы по теме:

Сила голоса. Что обсуждали на Дне открытых дверей PLAY FM
Все материалы сюжета Здоровый голос Залог успеха для радио — это, конечно же, голос. Ведь искусство радио основано на звуковом сопровождении. И голос ведущих должен быть безупречным. Основное требование к радийному оратору заключается в красивом тембральном окрасе и отсутствии так называемых мелизмов (лишних эмоциональных окрашиваний ...
За симптомами аутизма стоит задержка в передаче сигналов в мозге
Специалисты в сфере неврологии из Университета штата Юта установили, что симптомы аутизма могут быть вызваны изменениями во взаимодействии различных областей мозга между собой. Работа проводилась под руководством Й. Андерсона. Результаты исследования были опубликованы сегодня в журнале JAMA Network Open. Одной ...
Полевая кухня. Что приготовить из весенней зелени
Статья из газеты: АиФ Здоровье №9 14/05/2019 Крапива, одуванчик, сныть – это не просто сорняки, а ещё и отличная витаминная подпитка. Не упустите шанс приготовить вкусные и полезные блюда из весенней зелени. Наш эксперт – врач-диетолог, специалист по anti-age питанию Анжелика Дюваль. Сныть Когда с­обирать. Для сушки сныть ...
Какие заболевания поможет вылечить чёрная смородина?
Наш эксперт – преподаватель Пятигорской государст­венной фармацевтической академии, профессор Валерий Мелик-Гусейнов. В качестве общеукрепляющего средства после перенесённых инфекционных заболеваний рекомендуется такой сбор: 2 чайные ложки смеси в равных количествах чёрной смородины, черники обыкновенной и бузины чёрной заваривают 1 стаканом кипятка, настаивают 1 час, ...

Добавить комментарий

Войти с помощью: 

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *

Читайте ранее:
Перед встречей с Зеленским у депутатов забрали телефоны

КИЕВ, 5 сен - РИА Новости. На заседании парламентской фракции партии "Слуга народа", которое прошло...

МЭР ответило на критику Мутко по поводу поддержки предпринимателей в Тулуне

МОСКВА, 5 сен - РИА Новости. Минэкономразвития РФ ответило на критику вице-премьера Виталия Мутко по...

Закрыть
Яндекс.Метрика