Разработан новый метод поиска агрессивных опухолей

Разработан новый метод поиска агрессивных опухолей

Исследовательская группа из Каролинского Института в Швеции разработала новый дешевый метод идентификации гетерогенных опухолей. Проектом руководили доктора Магда Биенко и Николо Крозетто. Методика была опубликована 18 октября в научном журнале Nature Communications.

Общей чертой раковых клеток является изменение количества копий, в которых каждая хромосома или ген присутствует в геноме — явление, известное как изменение числа копий (или CNAs). Внутри одной и той же опухоли клетки, принадлежащие к разным анатомическим частям опухоли, могут нести разные CNA. Опухоли со многими CNA, как правило, очень агрессивны и могут продолжать развиваться даже после активного лечения самыми «тяжелыми» препаратами.

Теперь же в лаборатория Биенко-Крозетто разработали новый геномный метод, названный CUTseq, который может оценивать количество и тип CNAs во многих различных частях одной и той же опухоли. Этот метод работает с ДНК, полученной из нескольких биопсий или даже из очень маленьких частей срезов тонкой ткани – этот тип образца врачи использует для диагностики рака под микроскопом. Пометив ДНК, выделенную из нескольких областей одного и того же образца опухоли, уникальными молекулярными штрих-кодами, можно получить исчерпывающую картину гетерогенности CNA в опухоли с помощью одного эксперимента по секвенированию.

По словам авторов, CUTseq можно использовать не только для диагностики онкологических заболеваний, но и в качестве платформы для аутентификации клеточных линий и для мониторинга стабильности генома в больших хранилищах и биобанках. Он также может применяться в экологии как альтернатива другим методам секвенирования генома с пониженной репрезентацией, таким как RAD-seq, для оценки биоразнообразия. Ученые считают, что для подобных задач метод CUTseq является оптимальным, в том числе благодаря своей низкой стоимости реализации.

Материалы по теме:

Вакцина против опоясывающего герпеса снижает риск инсульта
Опоясывающий герпес – инфекция, вызываемая вирусом ветряной оспы – связана с повышенным риском инсульта. Новое исследование Центра по контролю и профилактике заболеваний в Атланте (США) доказало, что вакцинация против опоясывающего лишая может предотвратить нарушение мозгового кровообращения у пожилых людей. Результаты исследования ...
Ученые нашли объяснение «счастливой гипоксии» у ковидных пациентов
Многие пациенты с COVID-19, имеющие крайне низкий уровень кислорода, не демонстрируют при этом одышки и других признаков дыхательной недостаточности. Специалисты из Чикагской школы медицины Stritch при Университете Лойолы, похоже, нашли этому объяснение. Исследования под названием «Почему тихая гипоксемия COVID-19 ставит в ...
Ученые нашли способ быстро и просто считать метаболиты в капле крови
Специалисты Гронингенского университета (Нидерланды) разработали систему, которая способна измерять уровень нескольких метаболитов одновременно в различных биологических жидкостях, при этом процесс занимает всего несколько секунд. Новая технология может использоваться в том числе в устройствах домашней диагностики. Результаты исследования были представлены сегодня в ...
Цезарю и не снилось. Как научиться работать в режиме многозадачности
​Как стать королем многозадачности и почему для этого вам придется научиться жонглировать и учить стихи, объясняет бизнес-тренер и коуч Юлия Куликова-Цай. Вы умеете пить кофе, слушать музыку, параллельно общаться с друзьями в социальных сетях и варить борщ? Поздравляем, такой популярный сегодня навык, как ...

Добавить комментарий

Войти с помощью: 

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *

Яндекс.Метрика